相傳肉圓的歷史是當時台灣發生了嚴重水災，在北斗地區的寺廟擔任文筆生的范萬居先生依照神明降駕指示，將地瓜浸濕，壓成團後揉成團狀，加上花菜，再做成粿仔的形狀煮熟給災民食用賑災。

後來經過長期改良，又流傳到台灣各地，也產生了各地不同用料與做法的特色肉圓。